OmicsExplorer 组学数据分析平台
2008-05-27
OmicsExplorer是一个提供高通量生物组学数据处理分析的系统化平台，适合传统生物学家，生物信息学家，数据分析人员，以及数据分析流程解决方案构建者等使用。
五大数据分析领域
l 序列数据分析
l 生化数据分析
l 进化分析
l 统计学分析
l 机器学习及文本挖掘
通用需求解决方案
l 为传统分析方法建立数据分析流程
l 提供高通量数据提交和管理
l 指导用户进行数据处理分析
l 为大批量运算提供服务端管式
l 完整的数据分析过程及结果记录
l 详细的分析过程及方法展示
特定需求解决方案
l 支持自定义构建数据分析流程方案
l 为有特殊需求用户构建分析流程
l 额外的数据提交及存储空间
l 额外的计算机硬件资源
技术支持及特性
l 基于Inforsence KDE系统内核，对服务流程进行系统化维护和管理
l 以Web方式提供服务，支持各种平台的客户端访问
l 兼容多种程序语言脚本，包括Java，Perl，Groovy，R等
l 提供多种生物信息学分析软件，统计学分析工具
l 对数据的格式和分析流程提供规范化标准
l 专业开发维护团队提供技术支撑
成功案例
l 自主研发的GEOGLE系统，一个针对NCBI GEO数据库的数据挖掘工具
n 根据生物医学词汇或芯片数据号，搜索差异表达的基因或代谢通路
n 根据提交的基因和代谢通路，搜索相关数据集并和生物医学词汇关联
n 根据提交的芯片数据对整个数据库做表达相似性搜索，和生物医学词汇关联 
整合大量常用数据分析
l 蛋白质序列，核酸序列注释功能
l 基于BBH规则的，蛋白及核酸序列同源搜索(Blast)工具
l 根据同义/非同义突变率计算COG分类富集程度的进化分析
l 包括蛋白质变性温度计算，酶动力学分析，反应速率预测在内的生化分析
l 和多种在线公共数据库偶联的文本挖掘系统
l 统计作图软件，基于Bayesian模型，决策树，神经网络，SVM等方法的分类工具，基于Kmeans，EMCluster的聚类工具
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