SysQuant是用于蛋白质组数据分析基于质谱的定量分析软件，支持了标记定量和非标记定量多种的实验方法。采用mzXML数据输入方式，能支持不同厂商的高分辨率质谱仪器，具有较好的通用性。可根据Sequest等定性软件输出得到肽段和蛋白质的定量结果，与国际上同类的软件相比具有更高的精度和较好的易用性。