转录调控分析平台
2008-05-27
分析针对的目标物种
人，Homo sapiens
小鼠，Mus musculus
大鼠，Rattus norvegicus
所提供的分析内容
分析蛋白序列特征鉴定可能的转录因子并对转录因子进行分类。
分析转录因子氨基酸序列上的DNA结合残基。
鉴定调控序列的转录因子结合位点（Transcription Factor Binding Sites）。
预测“转录因子-靶基因”转录调控关系，在此基础上构建转录调控网络。
技术支持以及服务特色
搜集整理了大量转录因子结合位点程序。而且本地集群服务器上调试安装了成熟软件的本地版本，可以很快地执行运算任务。包含了MEME、AlignACE等软件系统。
搜集整理了转录调控序列数据库。包含了已知的TRANSFAC、DBTSS等数据库。同时搜集了调控序列的比对信息，拥有调控序列保守序列片断数据库。
搜集整理了表达谱数据，包括了GEO本地版本和一些公司搜集的数据集。以支持转录调控关系的鉴定。
拥有一套完整的文本挖掘工具集合。一方面可以从文献中挖掘转录因子DNA结合位点、转录调控关系等信息；另一方面可以为计算机软件系统预测结果提供文献支持了和质量评估。
使用案例
使用蛋白序列特征，对人基因组的转录因子进行预测和分类，结果展示 
使用表达谱数据预测预测“转录因子靶基因”转录调控关系，结果展示
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